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洪义国
研究员
方向:热带海洋动力过程的环境效应 行政职务:
学科专业:微生物海洋学 导师:硕士导师
办公电话:020-89023345
电子邮箱:yghong@scsio.ac.cn
通讯地址:广州市新港西路164号2号楼1903

研究方向

研究方向为海洋环境于分子微生物学,探索在全球气候和环境变化背景下以微生物引擎作用为核心的“海洋物质循环-微生物代谢-区域生态环境”相互作用的科学问题,主攻海洋微生物氮循环方面的研究,在自然及人类活动条件下的典型热带河口及边缘海的微生物氮循环过程研究中取得了积极进展。主持承担多项科研项目,其中国家自然科学基金项目3项,中国科学院人才类项目3项,广东省自然科学基金重点项目1项。在国内外重要学术期刊上发表论文50余篇,其中在Appl. Environ. Microbiol.,Appl. Microbiol. Biotechnol,J. Microbiol.Biotechnol., Systematic & Applied Microbiology,Geobiology等国际主流期刊上发表SCI索引学术论文30余篇,论文被总引800余次,H指数16。曾获得首届中国科学院卢嘉锡青年人才奖,中国科学院优秀博士论文提名奖,中国科学院院长优秀奖,中国水产科学研究院科技进步一等奖(第四完成人),青岛市技术发明奖二等奖(第五完成人)。在第十次全国环境微生物学术研讨会上获得“简浩然环境微生物学基金”优秀论文。担任PLOS ONE 学术编辑,国际期刊International Biodeterioration & Biodegradation编委,2011年入选中国科学院青年促进会并受到青促会的基金资助。

个人详细介绍

l 受教育经历

      2004/09-2007/07,中国科学院华南植物园,博士;

      1998/09-200/07,青岛海洋大学(现中国海洋大学),海洋生命学院,硕士;

      1994/09-1998/07,内蒙古大学,生命科学学院,学士

l 研究工作经历

      2013/11-至今,中国科学院南海海洋研究所,热带海洋环境国家重点实验室,研究员;

      2010/10-2011/10,美国普林斯顿大学(PrincetonUniversity),地球科学系,访问学者;

      2009/09-2013/11中国科学院南海海洋研究所,热带海洋环境国家重点实验室,副研究员;

      2009/11-2010/04,厦门大学,近海海洋环境国家重点实验室,访问学者;

      2007/09-2008/09,香港大学,生物系,访问学者;

      2007/07-2009/08,中国科学院南海海洋研究所,助理研究员;

      2001/07-2004/03,中国水产科学研究院黄海水产研究所,助理研究员。

l 期刊编委:

   1. 任PLOS ONE 学术编辑;

   2. 任国际期刊InternationalBiodeterioration & Biodegradation编委;

   3.   任期刊Regional Studies in Marine Science编委。

l 获奖情况:

   1. 获得2008年度首届中国科学院卢嘉锡青年人才奖;
   2. 获得2008年度中国科学院优秀博士论文提名奖;
   3. 获得2007年度中国科学院院长奖;
   4. 获得2001年度水科院科技进步一等奖,为第四完成者;
   5. 获得青岛市2003年技术发明奖二等奖,为第五完成者。

l 科研项目:

1.   珠江口硝化-反硝化-厌氧氨氧化耦合过程驱动的脱氮机制及关键环境影响因素研究(31270163),国家自然科学基金,2013.1-2016.12

2.   氮循环的微生物海洋学研究,中国科学院青年促进会人才专项课题,2011.10-2014.10.

3.   氨氧化古菌(AOA)在南海北部的群落结构、活性及生态效应(41076095),国家自然科学基金项目,2011.1-2013.12

4.   珠江口活性氮转化过程中的微生物海洋学机制研究.中国科学院知识创新工程重要方向项目(青年人才类)(KZCX2-YW-QN207).PI.

5.   南中国海细菌厌氧氨氧化作用机制及关键驱动因素(30800032),2009.1-2011.12.国家自然科学基金项目

6.   腐殖质物质在海洋环境净化中的作用及机制研究(07SC011009),2007.92010.8中科院南海所青年人才领域前沿项目

7.   细菌厌氧氨氧化在南海海洋生态系统氮物质循环中的作用, 2008.1-2010.12,中国科学院院长奖获得者科研启动专项资金。

8.   南海海洋厌氧氨氧化细菌的分子生态分布及特征(84510301001692),2008.10-2010.9.广东省自然科学基金项目

9.   活性氮超负荷条件下典型河口区氮素循环的微生物泵作用机制(LMEB201002),2010.9-2012.8,国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室(LEMB)开放研究基金资助项目.

10.  海洋环境细菌厌氧氨氧化研究(MELRS0911),近海海洋环境科学国家重点实验室(厦门大学)访问学者与开放课题基金项目。

l 主要论著:

1.  HongY.*, XuX., Kan J., Chen F. Linking seasonal inorganic nitrogenshift to the dynamics of microbial communities. Appl. Microbiol. Biotechnol. Published online. DOI: 10.1007/s00253-013-5337-4,2013. IF=3.689

2.  HongY. *, Wang Y., Chen F. Archaea dominatesammonia-oxidizer in the Permian water ecosystem of midland basin. Microbes and Environments. 28: 396-399, 2013. IF=2.230

3.  HongY.*, WuP., Li W., Gu J., Duan S. Humic analogAQDS and AQS as an electron mediator can enhance chromate reduction by Bacillus sp. strain 3C3. Appl.Microbiol. Biotechnol.93: 2661-2668,2012. IF=3.689.

4.  Hong Y., Li M., Cao H., Gu J.-D.* Residenceof habitat-specific anammox bacteria in the deep-sea subsurface sedimentsof South China Sea: analyses of marker gene abundance context withphysicochemical parameters. MicrobialEcology. 62: 36-47,2011. IF=3.689

5.  Hong Y. *, Yin B., Zheng T.-L. Diversity and abundance of anammoxbacterial community in the deep-ocean surface sediment from equatorial Pacific.Appl. Microbiol. Biotechnol., 89: 1233-1241, 2011.  IF=3.689

6.  Hong Y., Gu J.-D.* Physiology and biochemistry of reduction of azocompounds by Shewanella strainsrelevant to electron transport chain. Appl. Microbiol. Biotechnol.88:637-643, 2010.  IF=3.689

7.  Hong Y., Gu J.-D*. A review on bacterial anaerobic respiration andelectron transfer relevant to the biotransformation of pollutants. InternationalBiodeterioration & Biodegradation. 63:973-980, 2009. IF=2.252.

8.  Hong Y., Guo J., Sun G.* Energy generation coupled to the azoreduction by themembranous vesicles from Shewanelladecolorationis S12. J. Microbiol. Biotech.19:37-41, 2009.  IF=1.463

9.  Hong Y., Guo J., Sun G*. Identification of an uptake hydrogenase forhydrogen-dependent dissimilatory azoreduction by Shewanelladecolorationis S12.Appl. Microbiol. Biotechnol. 80:517-524, 2008. IF=3.689

10.  Hong Y., Guo J., Sun G*. Characteristic and phylogenetic analysis of facultativeanaerobic dissimilatory azoReducting bacteria from anaerobic actived sludge. International Biodeterioration &Biodegradation. 61: 313-318, 2008.IF=2.252.

11.  Hong Y., Xu M., Guo J.,Xu Z., Chen X., Sun G*. Respirationand growth of Shewanella decolorationisS12 with an azo compound as sole electron acceptor. Appl. Environ. Microbiol.73: 64-72, 2007. IF=3.686.

12.  Hong Y., Chen X., Guo J., Xu Z., Xu M., Sun G*. Effects of electron donors and acceptors onanaerobic azo dyes reduction by Shewanelladecolorationis S12. Appl. Microbiol.Biotechnol.74:230-238, 2007. IF=3.689

13.  Hong Y., Guo J., Xu Z.,Xu M., Sun G*. Humicsubstances act as electron acceptor and redox mediator for microbialdissimilatory azoreduction by Shewanelladecolorationis S12. J. Microbiol.Biotech.17:428-437, 2007.IF=1.463.

14.  Hong Y., Guo J., Xu Z.,Mo C., Xu M., Sun G*. Reduction and partial degradation mechanism of naphthylaminesulfonic azodye amaranth by Shewanella decolorationis S12.Appl. Microbiol. Biotechnol. 75: 647-654, 2007. IF=3.689

15.   Li M., Cao H., Hong Y., Gu J.-D*. Using the variation ofanammox bacteria community structures as a bio-indicator foranthropogenic/terrestrial nitrogen inputs in the Pearl River Delta (PRD). Appl.Microbiol. Biotechnol.97:9875–9883, 2013. IF=3.689

16.   Li M., Hong Y., Cao H., Gu J.-D. Community structures and distribution of anaerobicammonium oxidizing and nirS-encoding nitrite-reducing bacteria in surfacesediments of the South China Sea. MicrobialEcology. 66: 281-296, 2013IF=3.277

17.  Li M., Hong Y., Cao H., Klotz M. G., Gu J.-D. Diversity, abundance and distributionof NO-forming nitrite reductase-encoding genes in deep-sea subsurface sedimentsof the South China Sea (SCS). Geobiology.11: 170-179, 2013. IF=4.11

18.  Cao H., Hong Y., Li M. and Gu J.-D.* Community shift of ammonia-oxidizingbacteria along an anthropogenic pollution gradient from the Pearl River Deltato the South China Sea.Appl. Microbiol. Biotechnol., 94:247-259, 2012.IF=3.689

19.  Cao H. L., Li M., Hong Y.,Gu J.-D*. Lower abundance ofAmmonia-oxidizing Archaea than ammonia-oxidizing bacteria detected in the subsurfacesediments of the northern South China Sea. Geomicrobiol.J. 29:4332-4339, 2012.  IF=2.017

20.  Cao H., Hong Y., Li M., Gu J.-D*.Phylogenetic diversity and ecological pattern of ammonia-oxidizing Archaea inthe surface sediments of the western Pacific. Microbial Ecology.62:813-823, 2011. IF=3.277

21.   Li M., Hong Y., Gu J.-D. *Mangrove trees affect the community structure and distribution of anammoxbacteria at an anthropogenic-polluted mangrove in the Pearl River Deltareflected by 16S rRNA and hydrazine oxidoreductase (HZO) encoding geneanalyses.Ecotoxicology.20:1780-1790, 2011.IF=2.773

22.  Cao H., Hong Y., Li M., Gu J.-D*. Diversityand abundance of ammonia-oxidizing prokaryotes in sediments from the coastalPearl River estuary to the South China Sea. Antonievan leeuwenhoek. 100:545-556, 2011.IF=1.673

23.  Cao H.L., Li M., Hong Y., Gu J.-D*. Diversity and abundance of ammonia-oxidizingarchaea and bacteria in polluted mangrove sediment. Systematic and Applied Microbiology. 34: 512-523, 2011. IF=3.366

24.  LiM., Cao H., Hong Y., Gu J.-D*. Seasonal dynamics of anammoxbacteria in estuarial sediment of the Mai Po nature reserve revealed by analyzing the 16S rRNA and hydrazineoxidoreductase (hzo) genes. Microbes and Environments. 26: 15-22, 2011. IF=2.230.

25.  LiM., HongY., Cao H., GuJ.-D*. Spatial distribution and abundances of ammonia-oxidizing archaea (AOA)and ammonia-oxidizing bacteria (AOB) in mangrove sediments.Appl. Microbiol. Biotechnol.89: 1243-1254, 2011. IF=3.689

26.  LiM., Hong Y., Martin G. K.., GuJ.-D*. A comparison of primer sets for detecting 16S rRNA and hydrazineoxidoreductase genes of anaerobic ammonium-oxidizing bacteria in marinesediments. Appl. Microbiol. Biotechnol.86: 781-790, 2010. IF=3.689

27.  Wang Y., Yin B., Hong Y., Yan Y., Gu J.-D. (2008) Degradation of dimethyl carboxylicphthalate ester by Burkholderia cepaciaDA2 isolated from marine sediment of South China Sea. Ecotoxicology.17:845-852, 2008.  IF=2.773

28.  洪义国*. 硝酸盐氮氧稳定同位素分馏过程记录的海洋氮循环研究进展. 地球科学进展. 28( 7) : 751-764, 2013.